自然科学研究所于2006年12月28日在根据2006年3月17日第5467号法律成立的穆罕默德·阿基夫·埃尔索伊大学内开始开展活动。
使命
自然科学研究所的使命是：在自然科学领域，率先培养具有高素质研究能力、知识与技能的人才；为实现这一目标，确保教育项目持续改进、评估并有效实施；促进所有项目教育质量的提升；支持国家和国际联合研究活动及项目工作；为此鼓励开设新项目，并在即将开展的论文研究中优先考虑我国和人民的需求，为世界科学作出贡献。
愿景
自然科学研究所的愿景是：成为一所备受尊重的机构，受到高素质且相信所受专业教育将提升生活质量的学生青睐；其毕业生凭借所受教育在各自领域占据卓越地位；通过所实施的教育项目为大学培养高素质科学人才；支持科学技术研究，并在国家和国际层面不断扩大并持续推进。按照当今需求和对未来的正确预判，持续实施并不断更新研究生层次教育教学项目，采用注重以研究为基础的学习的教育教学方法。在科学研究活动中重视大学—产业—机构—组织合作，为国家和国际创新的开发与推广营造环境。
